TP7 a la decouverte de l’adn








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date de publication26.03.2017
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TP7 A LA DECOUVERTE DE L’ADN


Histoire des sciences (pour les curieux) : La molécule d’ADN (molécule universelle porteuse de l’information génétique) a été découverte dans les années 20 puis précisée dans les années 40 par Avery &Co. Les enjeux militaires au cours de la seconde guerre mondiale ont participés à la mise au point et à l’amélioration de nombreuses techniques scientifiques. L’une d’entre elle est la diffraction aux rayons X. Cette technique permet d’étudier la structure fine des molécules.

Watson et Crick ont tout d’abord créé un MODELE de la structure de l’ADN, modèle qui fût ensuite confirmé par la diffraction aux rayons X. Cela leur vaudra le prix noble de médecine en 1952

Nous allons donc aujourd’hui essayer de déterminer, nous aussi, la structure de la molécule d’ADN
Problème : Quelle est la structure de la molécule d’ADN ?

Activité 1 : Architecture générale de la molécule


Ouvrez le logiciel Rastop. Faites apparaître à l’écran la molécule d’ADN. Pour cela allez dans « fichier/ouvrir/molécule/adn_arn/ADNPDB. Pour colorer les atomes, cliquez sur l’icone représentant deux carrés avec une liaison. Vous pouvez faire pivoter la molécule en maintenant le clic gauche de la souris maintenu.

Décrivez à l’aide de termes simples la forme en 3D de la molécule.

Colorez la molécule par chaîne en allant dans « atomes », « colorer par » « chaîne ». De combien de chaînes la molécule est-elle composée ?
Activité 2 : Organisation des différents constituants

A l’aide du document 4 p55 répondez aux questions suivantes :

Enumérez les unités de base de l’ADN ? Précisez la composition de chacune d’entre elles (vous pouvez vous aider du document 2p54.

Calculez les rapports (A/T) et (C/G) pour chaque ligne du tableau. Que remarquez-vous ?

Ra1 (Formuler une ou des hypothèse(s) répondant au problème) J L


Moi

Professeur

Justesse : L’hypothèse est plausible, réaliste

 

 

Complétude : L’hypothèse permet de répondre à l’ensemble du problème

 

 

Cohérence : Hypothèse est en lien avec le problème

 

 
Formulez une hypothèse permettant d’expliquer ces résultats (à propos de la disposition des nucléotides au sein de la molécule d’ADN)

Remettre la molécule d’ADN (« adn.pdb »). Colorez la molécule selon la nature des nucléotides : « atomes/colorer par/forme ». La correspondance des couleurs est la suivante :

Nucléotide

Adénine

Cytosine

Thymine

Guanine

Couleur

Bleu

Orange

Vert

Rouge

Votre hypothèse est-elle confirmée? Justifiez.



Ra2 (Utiliser des informations pour éprouver une hypothèse) J L


Moi

Professeur

Justesse : Les informations utilisées sont bien interprétées

 

 

Complétude : Toutes les informations sont utilisées

 

 

Cohérence : Les informations extraites sont mises en lien avec l’hypothèse

 

 

Pertinence : Seules les informations utiles sont utilisées

 

 


Fermez le fichier « adn.pdb » et ouvrir le répertoire nucléotides puis le fichier « NUC2ATH.PDB » ou « NUC2GCH.PDB ». Repérez les deux nucléotides concernés et schématisez leur disposition l’un par rapport à l’autre.

Question Bonus pour les rapides : sur le logiciel rastop, afficher les liaisons hydrogènes « liaisons/liaisons hydrogènes/afficher ».

La disposition de ces liaisons confirme-t-elle la complémentarité des nucléotides ?

Activité 4 : bilan

Reconstituez dans le cours (P6) le puzzle de la molécule d’ADN à l’aide du document joint.






A
AGTCCT

2nde / la Terre, planète habitée – TP7 Page


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